防護性是醫用防護服最為重要的性能要求，主要包括液體阻隔、微生物阻隔和對顆粒物質的阻隔等方面。
液體阻隔性指醫用防護服應能防止水、血液、酒精等液體的滲透，具有4級以上的疏水性，以免沾污衣服和人體。避免在手術過程中病人的血液、體液及其他分泌物等將攜帶的病毒傳染給醫務人員。
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微生物阻隔性包括對細菌和病毒的阻隔。對細菌的阻隔主要是防止手術過程中醫護人員向病人的手術創面的接觸性傳播(和反向傳播)。對病毒的阻隔主要是防止醫護人員接觸病人的血液和體液時，其中攜帶的病毒引起醫患之間交叉感染。顆粒物質阻隔性指防止通過空氣進行傳播的病毒以氣溶膠的形式被吸入或附著在皮膚表面被人體吸收。
當然舒適性也是非常重要的，舒適性包括透氣性、水蒸氣穿透性、懸垂性、質量、表面厚度、靜電性能、顏色、反光性、氣味和皮膚致敏性等。最主要的是透氣、透濕性能，為了增強防護效果，防護服面料通常經過層壓或復膜處理，造成厚重且透氣、透濕性差，長期穿著不利于排汗排熱。抗靜電性要求是為了防止在手術室內靜電會導致手術服吸附大量的灰塵和細菌對患者傷口不利，同時防止靜電產生的火花引爆手術室內的揮發性氣體、影響精密儀器的準確性。
醫用防護服除了前面所列的性能外，還需具有消毒耐受性、具有良好的水洗色牢度、防止縮水、不助燃、無毒無刺激性，對皮膚無害等性能。
